1. [명사] 눈으로는 볼 수 없는 아주 작은 생물. 보통 세균, 효모, 원생동물 따위를 이르는데, 바이러스를 포함하는 경우도 있다.
2. 담체의 표면이나 가는 구멍 사이에 미생물을 결합시킨 담체. 고정된 결합 담체에는 합성수지, 세라믹, 규사, 제올라이트, 활성탄 따위가 있다.
3. [명사] 미생물의 분야.
4. 미생물을 배양하여 약품, 식료품 따위를 만드는 공업.
5. 미생물이나 세균 따위에 대해 비정상적인 공포를 느끼는 병적 증상.
6. 산업적 또는 상업적으로 이용되는 미생물이나 미생물의 산물에 관련된 분야. 미생물 관련 학문 분야 가운데 발효 공업을 기초로 하여 미생물을 이용하는 응용 공학의 한 분야이다.
7. 미생물을 순수하게 분리하여 배양한 균주. 실험 과정에서 특정 미생물이 필요할 때 여기에서 추출하여 사용한다.
8. 미생물을 국제 기탁 기관으로서의 지위를 취득한 기관 따위에 기탁하는 일. 연구자가 보유하고 있는 유용한 균주를 여러 연구자에게 공개하고 안전하게 보존하기 위한 제도이다. 국내 및 국외 학술지 따위를 통하여 그 성질이 발표된 균주를 기탁할 수 있다.
9. 세균, 바이러스 따위를 써서 해로운 벌레나 병균 따위를 잡는 농약.
10. [명사] 단백질이 많은 미생물로 만든 가축의 먹이. 효모나 곰팡이에는 단백질이 많이 있으므로, 이들이 자라는 데 필요한 조건을 만들어 인공적으로 배양하여 먹이로 쓴다.